Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc85aQ5SP85 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc85aQ5SP85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms