Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scarf1Q5ND28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scarf1Q5ND28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms