Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnni3kQ5GIG6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnni3kQ5GIG6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnni3kQ5GIG6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms