Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ecm2Q5FW85 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ecm2Q5FW85 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm2Q5FW85 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm2Q5FW85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms