Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znf354cQ571J5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znf354cQ571J5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms