Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnl1Q52KE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnl1Q52KE7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnl1Q52KE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms