Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
6430531B16RikQ3V2J1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms