Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ckap2Q3V1H1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ckap2Q3V1H1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ckap2Q3V1H1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms