Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ankrd53Q3V0J4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd53Q3V0J4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms