Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms