Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Garnl3Q3V0G7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Garnl3Q3V0G7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Garnl3Q3V0G7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms