Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrfip1Q3UZ39 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrfip1Q3UZ39 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrfip1Q3UZ39 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms