Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kdm5aQ3UXZ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5aQ3UXZ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms