Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mbd3l2Q3UXB0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mbd3l2Q3UXB0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms