Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Znf48Q3US17 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf48Q3US17 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf48Q3US17 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms