Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TceancQ3US16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TceancQ3US16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TceancQ3US16 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms