Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Q3UPC7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UPC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Q3UPC7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3UPC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms