Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD9

Agap2, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agap2Q3UHD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Agap2Q3UHD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agap2Q3UHD9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agap2Q3UHD9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms