Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rapgef1Q3UHC1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rapgef1Q3UHC1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef1Q3UHC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms