Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgef3Q3UGY8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef3Q3UGY8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef3Q3UGY8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms