Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rsph3aQ3UFY4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rsph3aQ3UFY4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rsph3aQ3UFY4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms