Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Parp8Q3UD82 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Parp8Q3UD82 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms