Protein–RNA interactions for Protein: Q3U962

Col5a2, Collagen alpha-2(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a2Q3U962 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col5a2Q3U962 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col5a2Q3U962 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col5a2Q3U962 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms