Protein–RNA interactions for Protein: Q3U497

Cd300lb, CMRF35-like molecule 7, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lbQ3U497 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cd300lbQ3U497 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lbQ3U497 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lbQ3U497 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms