Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl21Q3U410 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl21Q3U410 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms