Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vars2Q3U2A8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vars2Q3U2A8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms