Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tatdn3Q3U1C6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tatdn3Q3U1C6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tatdn3Q3U1C6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms