Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw18Q3TSA9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxw18Q3TSA9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms