Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp39Q3TIX9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms