Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam107bQ3TGF2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam107bQ3TGF2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam107bQ3TGF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms