Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

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Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stt3bQ3TDQ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stt3bQ3TDQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stt3bQ3TDQ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms