Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Defb25Q30KN8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms