Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trpm1Q2TV84 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Trpm1Q2TV84 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trpm1Q2TV84 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms