Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tdrd9Q14BI7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tdrd9Q14BI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms