Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Traf3ip1Q149C2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Traf3ip1Q149C2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Traf3ip1Q149C2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
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