Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Ttc39dQ0VF76 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ttc39dQ0VF76 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Ttc39dQ0VF76 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc39dQ0VF76 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc39dQ0VF76 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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