Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col19a1Q0VF58 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col19a1Q0VF58 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms