Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ttc21bQ0HA38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ttc21bQ0HA38 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ttc21bQ0HA38 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms