Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Runx2Q08775 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Runx2Q08775 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Runx2Q08775 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Runx2Q08775 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Runx2Q08775 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Runx2Q08775 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Runx2Q08775 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Runx2Q08775 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Runx2Q08775 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Runx2Q08775 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Runx2Q08775 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms