Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tff1Q08423 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms