Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrstQ06666 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms