Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp2Q06649 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms