Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cab39Q06138 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cab39Q06138 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms