Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nf1Q04690 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nf1Q04690 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms