Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnd1Q03719 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnd1Q03719 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms