Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr1Q03146 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddr1Q03146 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr1Q03146 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms