Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlh1Q02576 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlh1Q02576 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms