Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnb1Q02248 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnnb1Q02248 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnb1Q02248 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms