Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp1Q01514 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp1Q01514 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms