Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec23aQ01405 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23aQ01405 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23aQ01405 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms